أُعلن خلال العام 2014 إحداث معهد محمد السادس لتكوين الأئمة والمرشدين والمرشدات ويعهد إلى المعهد بتكوين الأئمة والمرشدين والمرشدات تكوينًا يؤهلهم للقيام بمهمة تبليغ أحكام الشريعة الإسلامية، وبيان مقاصدها وإبراز سماحتها ووسطيتها واعتدالها والمساهمة في الحفاظ على الوحدة الدينية للمجتمع وتماسكه ضمن ثوابت الأمة والمشاركة في الأنشطة الدينية والتربوية والثقافية. 

ويناط بالمعهد مهام تكوين الأئمة والمرشدين والمرشدات في مجال الإمامة والإرشاد وتمكينهم من المناهج والمعارف التي تؤهلهم للقيام بالمهام الموكولة إليهم، تكوين وتأهيل واستكمال تكوين القيمين الدينيي الأجانب، تنظيم دورات للتكوين المستمر في مجال اختصاصه، تنظيم أطوار دراسية وندوات وتدريبات لاستكمال خبرة الأئمة والمرشدين والمرشدات، وأيضًا تقديم استشارات وإنجاز خبرات والعمل على نشر الأبحاث والدراسات التي تندرج ضمن اهتمامه.